Η αναμόρφωση του συνολικού προϋπολογισμού εκτελείται εντός των ορίων της κατηγορία δαπάνης του εγκεκριμένου συνολικού προϋπολογισμού. Οι αναμορφώσεις του προϋπολογισμού θα πρέπει να ακολουθούν τους κανόνες διαχείρισης όπως έχουν αποτυπωθεί στην Πρόσκληση, Απόφαση, Σύμβαση ή Οδηγό διαχείρισης του έργου. Και γίνεται μέσω του webrescom (Ηλεκτρονικές Υπηρεσίες/ Προϋπολογισμοί / Νέο Αίτημα / Αίτημα Αναμόρφωσης Συνολικού Προϋπολογισμού)
Η αύξηση / μείωση του συνολικού προϋπολογισμού γίνεται μέσω του webrescom (Ηλεκτρονικές Υπηρεσίες/ Προϋπολογισμοί / Νέο Αίτημα / Αίτημα Συμπληρωματικού Συνολικού Προϋπολογισμού)
Με απόφαση του Προέδρου της Επιτροπής Ερευνών, κατόπιν σύμφωνης γνώμης του Προϊσταμένου Οικονομικών Υπηρεσιών (ΠΟΥ) του ΕΛΚΕ, δύναται να αναμορφώνεται ο αναλυτικός ετήσιος προϋπολογισμός κάθε έργου/προγράμματος ως ακολούθως (άρθρο 239 του ν.4957/2022):
α) οποτεδήποτε εντός του τρέχοντος οικονομικού έτους μετά από αίτημα του Επιστημονικού Υπευθύνου και έγγραφη συμφωνία του φορέα χρηματοδότησης, όπου απαιτείται (Ηλεκτρονικές Υπηρεσίες/ Προϋπολογισμοί / Νέο Αίτημα / Αίτημα Τροποποίησης Ετήσιου Προϋπολογισμού),
β) σε τριμηνιαία βάση και συγκεκριμένα το αργότερο έως τις 31 Μαρτίου, 30 Ιουνίου, 30 Σεπτεμβρίου και 31 Δεκεμβρίου εκάστου οικονομικού έτους, αν οι πραγματοποιηθείσες δαπάνες που εκτελέστηκαν εντός του τελευταίου ημερολογιακού τριμήνου υπερβαίνουν τα όρια ανά κατηγορία δαπάνης του εγκεκριμένου προϋπολογισμού.